財團法人年度結餘款運用於適用免稅的關鍵

【2026／05／20，台北訊】對教育、文化、公益與慈善性質之機關團體而言，當符合「教育文化公益慈善機關或團體免納所得稅適用標準」規定要件時，即可享有所得稅免稅的租稅優惠。然而，在近年國稅局查核案例中， 仍有機關團體因支出比例未達標，而編列結餘款使用計畫，卻因未依限辦理或執行不符等疏失，導致喪失免稅資格遭補稅。勤業眾信稅務部資深會計師陳惠明提醒，財團法人等機關團體對於結餘款使用計畫管理，應注意的重點及相關作業時限。

陳惠明指出，結餘款編列使用計畫應留意的重點包括：

一、結餘款使用計畫的期間，以結餘款發生年度之次年度起算4年內為限，若結餘款使用計畫期間變更，仍以結餘款發生年度次年起算4年內為限。

二、結餘款使用計畫需依各年度預計使用情形編列使用細項及金額，不能僅以全部總額編列。

三、結餘款使用計畫項目應具體明確，並與章程設立宗旨或業務相符。

四、結餘款如轉列基金（或財產總額），經主管機關核發同意函後，應向法院辦妥財產總額變更登記，並將變更後之法人登記證書檢送交稽徵機關。

後續結餘款使用期間，年度結餘款實際使用情形需依主管機關同意的使用計畫進行。若計畫的支出項目、金額或期間有變更，最遲應於原使用計畫期間屆滿之次日起3個月內向主管機關變更，且變更後結餘款使用計畫期間，仍以結餘款發生年度次年起算4年內為限。

若機關團體疏忽、未在原期間屆滿次日起3個月內申請變更，稽徵實務上會先進行輔導，給予限期3個月的補辦機會，但補辦變更後的計畫仍需於4年內執行完畢。

實務上也有可能發生計畫實際執行完畢後仍有結餘款，以致與原使用計畫不符的情況。為避免因結餘款未全數使用完畢而需補稅，當變更使用計畫考慮將未使用的結餘款轉列為基金，除了需經主管機關同意計畫變更外，也需向法院辦妥財產總額變更登記，這套結餘款轉列基金之作業程序，也需要在結餘款發生年度次年起算4年內完成。

若結餘款未能依使用計畫支出項目、金額或期間使用完竣，稽徵機關會就該年度之全部結餘款補徵所得稅。舉例來說，某機關團體110年度結餘款200萬元，已編列使用計畫並經主管機關查明同意於111到114年間支出使用，114年度為使用計畫最後年度，然該機關團體未能依使用計畫於114年度使用完畢，尚有50萬結餘款未使用完畢，以致未能符合免稅標準規定，依法應就全部結餘款200萬補稅，而非僅就剩餘的50萬結餘款課稅。

陳惠明同時提到，機關團體年度結餘款如已編列使用計畫，並經主管機關同意留供以後年度使用，該筆結餘款於後續年度動支時，不得列入使用年度的支出項目來重複計算支出比率。且若使用結餘款購置資產，因該結餘款已全數視為結餘款發生年度之支出，所以之後以該結餘款所購置之資產，也不能再分年提列折舊，以免重複列報支出。

最後，陳惠明提醒，當機關團體因當年度支出未達收入60%且結餘款超過50萬元，為符合免稅規定而編列結餘款使用計畫時，應對於後續結餘款妥善追蹤管理，掌握計畫的執行情形，尤其是完成計畫的4年期限，才是守住免稅資格的最佳作為。

勤業眾信稅務部資深會計師陳惠明