SAF-T-standardens krav til kobling mot standardisert MVA-koder og kontoplan gjør det også enkelt å avstemme bokførte transaksjoner mot både MVA- og Næringsoppgave. Det vil være naturlig at Skattemyndighetene gjør en slik avstemming for å sikre at rapporterte opplysninger stemmer med underliggende bokførte opplysninger.
Deloittes SAF-T analyseverktøy hjelper virksomheter med å lese innholdet i SAF-T-filen samt gjennomføre kontroller knyttet til bokførteopplysninger og avgiftsbehandling. Verktøyet kan også enkelt benyttes til å avstemme SAF-T-filer mot avgiftsoppgaven eller næringsoppgaven, f.eks. SAF-T for Januar og Februar sammenstilt med MVA-termin 1.