ניסים מנהל את תחום המיסים העקיפים הכולל ליווי עסקאות מקומיות ובינלאומיות בפן המיסוי העקיף. מתמחה בליווי חברות, מלכ"רים ומוסדות כספיים בכל תחומי המיסוי העקיף הכולל בין היתר בהשגת החלטות מיסוי מקדמיות במגוון נושאים בתחום המיסוי העקיף הכולל ניכוי מס תשומות, קביעת שיעור המע"מ, קביעת מחיר העסקה. וכן, שינוי סיווג לצרכי מע"מ לעניין מלכ"ר, עוסק או מוסד כספי. הוא עוסק בין היתר בתן חוות דעת בתחום המיסוי העקיף, וייצוג הלקוחות מול רשויות המס בדיוני שומות ובהשגת פרה-רולינג. לפני עבודתו בפירמה, ניסים עבד 11 שנים ברשות המיסים. בתפקידו האחרון כיהן כמנהל תחום מחלקה מקצועית מע"מ וכן כמאמן ארצי, אחראי על המתמחים באגף, למשך תקופה של חמש שנים. במסגרת תפקידו, ניסים היה אחראי על כתיבת הוראות פרשנות, הנחיות מקצועיות, החלטות מיסוי, פרה – רולינג והסדרי מיסוי בהסכם. כמו כן, הדריך בכל קורסי הרשות בנושא מע"מ (מבקרים, חוקרים, מפקחים, מכס וגביה ואכיפה).