En 1991, le projet In Extenso voit le jour, avec la création d’un cabinet d’expertise comptable et de services dédié à la TPE (Très Petite Entreprise), qui va connaître un très large développement en régions. Ainsi, In Extenso est devenu en 15 ans le troisième acteur sur le marché avec plus de 110 implantations en France et l’une des gammes les plus complètes de services aux petites entreprises.

La firme française enregistre alors en une dizaine d’années un développement spectaculaire du nombre de ses clients, reconnaissance par le marché d'une politique ambitieuse de qualité et de développements de ses expertises. A titre d'exemple, le nombre de mandats d'audit confiés à Deloitte par les plus grandes entreprises françaises (Fortune F500) passe de 1 en 1990 à 13 en 2000. Parallèlement, sur cette même période, des cabinets français de premier plan comme Calan Ramolino ou PSAudit choisissent de se rapprocher de la Firme française.

En 2003, Deloitte & Touche France, se sépare de ses activités de conseil en stratégie, organisation et systèmes d’information. Avec cette nouvelle organisation recentrée sur les métiers du chiffre, Deloitte & Touche France se situe clairement comme un leader de la qualité et de la sécurité de l’information et des transactions financières.

La même année, la firme simplifie sa marque au niveau mondial et devient « Deloitte ».

En 2004, la Firme française a choisi d’appliquer les meilleures pratiques en termes de gouvernement d’entreprise et a séparé les responsabilités de Président de la Direction générale et de Président du Conseil d’administration, fonctions occupées depuis cette date respectivement par Jean-Paul Picard et Amadou Raimi.